Homo sapiens Gene: LAMA5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-84449.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LAMA5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | laminin, alpha 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000130702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
laminin, alpha 5
laminin, alpha 5
laminin, alpha 5
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Components of the extracellular matrix exert myriad effects on tissues throughout the body. In particular, the laminins, a family of heterotrimeric extracellular glycoproteins, affect tissue development and integrity in such diverse organs as the kidney, lung, skin, and nervous system. It is thought that laminins mediate the attachment, migration, and organization of cells into tissues during embryonic development by interacting with other extracellular matrix components. Laminins function as heterotrimeric complexes of alpha, beta, and gamma chains, with each chain type representing a different subfamily of proteins. The protein encoded by this gene belongs to the alpha subfamily of laminin chains and is a major component of basement membranes. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene, but the full-length nature of one of them has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes one of the vertebrate laminin alpha chains. Laminins, a family of extracellular matrix glycoproteins, are the major noncollagenous constituent of basement membranes. They have been implicated in a wide variety of biological processes including cell adhesion, differentiation, migration, signaling, neurite outgrowth and metastasis. Laminins are composed of 3 non identical chains: laminin alpha, beta and gamma (formerly A, B1, and B2, respectively) and they form a cruciform structure consisting of 3 short arms, each formed by a different chain, and a long arm composed of all 3 chains. Each laminin chain is a multidomain protein encoded by a distinct gene. The protein encoded by this gene is the alpha-5 subunit of of laminin-10 (laminin-511), laminin-11 (laminin-521) and laminin-15 (laminin-523). [provided by RefSeq, Jun 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 20:62307955-62367312 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q13.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 21 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Alpha6Beta4Integrin pathway
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REACTOME |
Extracellular matrix organization pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
ECM proteoglycans pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
Laminin interactions pathway
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KEGG |
ECM-receptor interaction pathway
Small cell lung cancer pathway
Focal adhesion pathway
Pathways in cancer pathway
Amoebiasis pathway
Toxoplasmosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Beta1 integrin cell surface interactions
Alpha6 beta4 integrin-ligand interactions
Syndecan-1-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O15230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H7C5J6 O75079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.473256 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_005560 XM_006723796 XM_006723797 XM_006723798 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601033 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33502 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB010099 AB011105 AB067494 AF443072 AL354836 Z95636 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAM12527 BAA25459 BAA31347 BAB67800 CAB09137 CAC22310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 3911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||