Homo sapiens Gene: EXOSC1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-84835.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | EXOSC1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | exosome component 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000171311 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
exosome component 1
exosome component 1
exosome component 1
exosome component 1
exosome component 1
exosome component 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a core component of the exosome. The mammalian exosome is required for rapid degradation of AU rich element-containing RNAs but not for poly(A) shortening. The association of this protein with the exosome is mediated by protein-protein interactions with ribosomal RNA-processing protein 42 and ribosomal RNA-processing protein 46. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:97436142-97446017 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q24.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 33 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Butyrate Response Factor 1 (BRF1) destabilizes mRNA pathway
Tristetraprolin (TTP) destabilizes mRNA pathway
KSRP destabilizes mRNA pathway
mRNA decay by 3' to 5' exoribonuclease pathway
ATF4 activates genes pathway
PERK regulates gene expression pathway
Unfolded Protein Response (UPR) pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
Metabolism of proteins pathway
Regulation of mRNA stability by proteins that bind AU-rich elements pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9Y3B2 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B1AMU3 B1AMU4 R4GNH9 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 51013 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.632089 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_016046 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17286 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 606493 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS7459 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF151866 AK313717 AL355490 BC022067 CH471066 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD34103 AAH22067 BAG36460 CAI40782 EAW49936 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 51013 | ||||||||||||||||||||||