Homo sapiens Gene: GATA5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-85156.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | GATA5 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | GATA binding protein 5 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000130700 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
GATA binding protein 5
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a transcription factor that contains two GATA-type zinc fingers. The encoded protein is known to bind to hepatocyte nuclear factor-1alpha (HNF-1alpha), and this interaction is essential for cooperative activation of the intestinal lactase-phlorizin hydrolase promoter. In other organisms, similar proteins may be involved in the establishment of cardiac smooth muscle cell diversity. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 20:62463497-62475970 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.33 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
Hemostasis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9BWX5 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 140628 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_080473 XM_006723699 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:15802 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 611496 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13499 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AL499627 BC047790 BC117356 BC117358 CH471077 HM015595 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH47790 AAI17357 AAI17359 ADL14516 CAC36001 EAW75360 EAW75361 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 140628 | ||||||||||||||||||||||