Version 5.4
| Homo sapiens Gene: CRTAC1 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-85774.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | CRTAC1 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | cartilage acidic protein 1 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000095713 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
cartilage acidic protein 1
cartilage acidic protein 1
cartilage acidic protein 1
cartilage acidic protein 1
cartilage acidic protein 1
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| Protein Structure |
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| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
This gene encodes a glycosylated extracellular matrix protein that is found in the interterritorial matrix of articular deep zone cartilage. This protein is used as a marker to distinguish chondrocytes from osteoblasts and mesenchymal stem cells in culture. The presence of FG-GAP motifs and an RGD integrin-binding motif suggests that this protein may be involved in cell-cell or cell-matrix interactions. Copy number alterations in this gene have been observed in neurofibromatosis type 1-associated glomus tumors. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2011] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 10:97865000-98030828 | ||||||||||||||||||
| Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
| Band | q24.2 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q9NQ79 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 55118 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.500736 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_018058 NM_001206528 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:14882 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 606276 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS31266 CCDS55723 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 10447 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AJ276171 AJ279016 AJ421515 AK001182 AK292084 AL139239 AL358938 BC034245 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH34245 BAA91540 BAF84773 CAB98267 CAB98268 CAB98269 CAC08451 CAD13394 CAI12584 CAI12585 CAI14277 | ||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 55118 | ||||||||||||||||||