Homo sapiens Gene: PHF6 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-86805.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PHF6 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | PHD finger protein 6 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000156531 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PHD finger protein 6
PHD finger protein 6
PHD finger protein 6
PHD finger protein 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the plant homeodomain (PHD)-like finger (PHF) family. It encodes a protein with two PHD-type zinc finger domains, indicating a potential role in transcriptional regulation, that localizes to the nucleolus. Mutations affecting the coding region of this gene or the splicing of the transcript have been associated with Borjeson-Forssman-Lehmann syndrome (BFLS), a disorder characterized by mental retardation, epilepsy, hypogonadism, hypometabolism, obesity, swelling of subcutaneous tissue of the face, narrow palpebral fissures, and large ears. Alternate splicing results in multiple transcript variants, encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jun 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:134373253-134428790 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | q26.2 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8IWS0 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B4E138 Q5JRC6 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 84295 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.356501 Hs.597989 Hs.629209 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001015877 NM_032335 NM_032458 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:18145 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 300414 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14639 CCDS14640 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB058726 AC004383 AK290095 AK303369 AK303647 AL591668 AY157622 BC005994 CH471107 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH05994 AAO13214 BAB47452 BAF82784 BAG64426 BAG64650 CAI41600 CAI41601 EAX11762 EAX11763 EAX11765 EAX11766 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 84295 | ||||||||||||||||||||||||