Homo sapiens Gene: FMR1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-88380.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | FMR1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | fragile X mental retardation 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | FMRP; FRAXA; POF; POF1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000102081 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
fragile X mental retardation 1
fragile X mental retardation 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene binds RNA and is associated with polysomes. The encoded protein may be involved in mRNA trafficking from the nucleus to the cytoplasm. A trinucleotide repeat (CGG) in the 5' UTR is normally found at 6-53 copies, but an expansion to 55-230 repeats is the cause of fragile X syndrome. Expansion of the trinucleotide repeat may also cause one form of premature ovarian failure (POF1). Multiple alternatively spliced transcript variants that encode different protein isoforms and which are located in different cellular locations have been described for this gene. [provided by RefSeq, May 2010] The protein encoded by this gene binds RNA and is associated with polysomes. The encoded protein may be involved in mRNA trafficking from the nucleus to the cytoplasm. A trinucleotide repeat (CGG) in the 5\' UTR is normally found at 6-53 copies, but an expansion to 55-230 repeats is the cause of fragile X syndrome. Expansion of the trinucleotide repeat may also cause one form of premature ovarian failure (POF1). Multiple alternatively spliced transcript variants that encode different protein isoforms and which are located in different cellular locations have been described for this gene. [provided by RefSeq, May 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:147911951-147951125 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q27.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 61 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
RNA transport pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.596971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001185075 NM_001185076 NM_001185081 NM_001185082 NM_002024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14682 CCDS55518 CCDS55519 CCDS76039 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||