Homo sapiens Gene: CLCNKA | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-91284.7 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | CLCNKA | ||||||||||||||||||
Gene Name | chloride channel, voltage-sensitive Ka | ||||||||||||||||||
Synonyms | ClC-K1; CLCK1; hClC-Ka | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000186510 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chloride channel Ka
chloride channel Ka
chloride channel Ka
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the CLC family of voltage-gated chloride channels. The encoded protein is predicted to have 12 transmembrane domains, and requires a beta subunit called barttin to form a functional channel. It is thought to function in salt reabsorption in the kidney and potassium recycling in the inner ear. The gene is highly similar to CLCNKB, which is located 10 kb downstream from this gene. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:16018875-16034050 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | p36.13 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Ion channel transport pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.591533 Hs.736811 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001042704 NM_001257139 NM_004070 XM_006710071 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS167 CCDS41269 CCDS57973 | ||||||||||||||||||
HPRD | 03608 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||