Homo sapiens Gene: XRCC6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-9323.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | XRCC6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CTC75; CTCBF; G22P1; KU70; ML8; TLAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000196419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Vaccinia virus protein C16 influences the immune response by binding to the XRCC6/XRCC5 (Ku70/80) complex thus blocking PRKDC-dependent DNA sensing in fibroblasts
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The p70/p80 autoantigen is a nuclear complex consisting of two subunits with molecular masses of approximately 70 and 80 kDa. The complex functions as a single-stranded DNA-dependent ATP-dependent helicase. The complex may be involved in the repair of nonhomologous DNA ends such as that required for double-strand break repair, transposition, and V(D)J recombination. High levels of autoantibodies to p70 and p80 have been found in some patients with systemic lupus erythematosus. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 22:41621119-41664048 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q13.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 347 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME |
STING mediated induction of host immune responses pathway
2-LTR circle formation pathway
Integration of provirus pathway
Early Phase of HIV Life Cycle pathway
Processing of DNA ends prior to end rejoining pathway
Nonhomologous End-joining (NHEJ) pathway
IRF3-mediated induction of type I IFN pathway
Innate Immune System pathway
Double-Strand Break Repair pathway
Immune System pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
Disease pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Non-homologous end-joining pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Coregulation of Androgen receptor activity
Signaling events mediated by HDAC Class III
BARD1 signaling events
DNA-PK pathway in nonhomologous end joining
Regulation of Telomerase
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B1AHC9 F5H1I8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 2547 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.292493 Hs.500561 Hs.567992 Hs.625078 Hs.681716 Hs.730702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001288976 NM_001288977 NM_001288978 NM_001469 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:4055 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 152690 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS74871 CCDS14021 CCDS74870 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | Z83840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 2547 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||