Homo sapiens Gene: KDM1A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-93808.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | KDM1A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | lysine (K)-specific demethylase 1A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AOF2; BHC110; KDM1; LSD1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000004487 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lysine (K)-specific demethylase 1A
lysine (K)-specific demethylase 1A
lysine (K)-specific demethylase 1A
lysine (K)-specific demethylase 1A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Lysine-specific demethylase 1 (KDM1) is part of a repressor complex, along with key components that include histone deacetylase 1 or 2, RE-1 silencing transcription factor (REST), and co-repressor of REST (RCOR1). The KDM1/HDAC/REST/RCOR1 repressor complex is a significant component of host innate immunity.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a nuclear protein containing a SWIRM domain, a FAD-binding motif, and an amine oxidase domain. This protein is a component of several histone deacetylase complexes, though it silences genes by functioning as a histone demethylase. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:23019448-23083689 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p36.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 522 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME |
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
HDMs demethylate histones pathway
HDACs deacetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Hemostasis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Coregulation of Androgen receptor activity
Notch-mediated HES/HEY network
Notch signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.591518 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001009999 NM_015013 XM_005245786 XM_006710472 XM_006710474 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS30627 CCDS53278 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 09800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||