Homo sapiens Gene: SMPD2 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-95120.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SMPD2 | ||||||||||||||||||
Gene Name | sphingomyelin phosphodiesterase 2, neutral membrane (neutral sphingomyelinase) | ||||||||||||||||||
Synonyms | ISC1; NSMASE; NSMASE1 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000135587 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sphingomyelin phosphodiesterase 2, neutral membrane (neutral sphingomyelinase)
sphingomyelin phosphodiesterase 2, neutral membrane (neutral sphingomyelinase)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein which was initially identified as a sphingomyelinase based on sequence similarity between bacterial sphingomyelinases and a yeast protein. Subsequent studies showed that its biological function is less likely to be as a sphingomyelinase and instead as a lysophospholipase. [provided by RefSeq, Oct 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:109440763-109443919 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q21 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Ceramide signalling pathway
Glycosphingolipid metabolism pathway
Sphingolipid metabolism pathway
Signalling by NGF pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
Signal Transduction pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Sphingolipid metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI |
TNF receptor signaling pathway
p75(NTR)-mediated signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.55235 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_003080 XM_005267109 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5075 | ||||||||||||||||||
HPRD | 04608 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||