Homo sapiens Gene: HDAC1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-95712.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HDAC1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | histone deacetylase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | GON-10; HD1; RPD3; RPD3L1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000116478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
histone deacetylase 1
histone deacetylase 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
HDAC1 Inhibition decreases IFN-alpha responsiveness whereas its expression augments the IFN-alpha response, demonstrating that it modulates IFN-alpha-induced transcription.
Histone deacetylase 1 (HDAC1) is part of a repressor complex, along with key components that include HDAC2, RE-1 silencing transcription factor (REST), co-repressor of REST (CoREST), and lysine-specific demethylase (LSD) 1. The HDAC/CoREST/REST/LSD1 repressor complex is a significant component of host innate immunity.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Histone acetylation and deacetylation, catalyzed by multisubunit complexes, play a key role in the regulation of eukaryotic gene expression. The protein encoded by this gene belongs to the histone deacetylase/acuc/apha family and is a component of the histone deacetylase complex. It also interacts with retinoblastoma tumor-suppressor protein and this complex is a key element in the control of cell proliferation and differentiation. Together with metastasis-associated protein-2, it deacetylates p53 and modulates its effect on cell growth and apoptosis. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:32292086-32333635 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p35.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 816 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
Notch pathway
EGFR1 pathway
TGF_beta_Receptor pathway
TNFalpha pathway
IL6 pathway
TWEAK pathway
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REACTOME |
G0 and Early G1 pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
p75NTR negatively regulates cell cycle via SC1 pathway
Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity pathway
SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription pathway
NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription pathway
Degradation of beta-catenin by the destruction complex pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants pathway
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
Generic Transcription Pathway pathway
truncated APC mutants destabilize the destruction complex pathway
SMAD4 MH2 Domain Mutants in Cancer pathway
Signalling by NGF pathway
AXIN mutants destabilize the destruction complex, activating WNT signaling pathway
APC truncation mutants are not K63 polyubiquitinated pathway
AMER1 mutants destabilize the destruction complex pathway
Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant pathway
misspliced LRP5 mutants have enhanced beta-catenin-dependent signaling pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
Signaling by WNT in cancer pathway
Loss of Function of SMAD4 in Cancer pathway
Loss of Function of SMAD2/3 in Cancer pathway
AXIN missense mutants destabilize the destruction complex pathway
Signaling by TGF-beta Receptor Complex in Cancer pathway
Signaling by Wnt pathway
Mitotic G1-G1/S phases pathway
Signaling by NOTCH1 in Cancer pathway
APC truncation mutants have impaired AXIN binding pathway
deactivation of the beta-catenin transactivating complex pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
T41 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated pathway
FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
TGFBR2 MSI Frameshift Mutants in Cancer pathway
Signal Transduction pathway
misspliced GSK3beta mutants stabilize beta-catenin pathway
S45 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated pathway
Transcriptional activity of SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer pathway
deletions in the AMER1 gene destabilize the destruction complex pathway
SMAD2/3 MH2 Domain Mutants in Cancer pathway
Loss of Function of TGFBR2 in Cancer pathway
Cell Cycle pathway
SMAD2/3 Phosphorylation Motif Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer pathway
S33 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated pathway
HDACs deacetylate histones pathway
truncations of AMER1 destabilize the destruction complex pathway
phosphorylation site mutants of CTNNB1 are not targeted to the proteasome by the destruction complex pathway
TCF dependent signaling in response to WNT pathway
Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Chromatin organization pathway
Signaling by NOTCH pathway
repression of WNT target genes pathway
TGFBR1 KD Mutants in Cancer pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
deletions in the AXIN genes in hepatocellular carcinoma result in elevated WNT signaling pathway
Signaling by NOTCH1 pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants in Cancer pathway
RNF mutants show enhanced WNT signaling and proliferation pathway
TCF7L2 mutants don't bind CTBP pathway
Loss of Function of TGFBR1 in Cancer pathway
formation of the beta-catenin:TCF transactivating complex pathway
TGFBR1 LBD Mutants in Cancer pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
TGFBR2 Kinase Domain Mutants in Cancer pathway
XAV939 inhibits tankyrase, stabilizing AXIN pathway
Gene Expression pathway
S37 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated pathway
Disease pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
Hemostasis pathway
Signaling by TGF-beta Receptor Complex pathway
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KEGG |
Cell cycle pathway
Notch signaling pathway pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Huntington's disease pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH |
TGF-beta signaling pathway
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PID NCI |
Regulation of retinoblastoma protein
Validated nuclear estrogen receptor alpha network
Presenilin action in Notch and Wnt signaling
Validated targets of C-MYC transcriptional repression
Signaling events mediated by HDAC Class I
Notch-mediated HES/HEY network
Regulation of nuclear beta catenin signaling and target gene transcription
Glucocorticoid receptor regulatory network
E2F transcription factor network
Retinoic acid receptors-mediated signaling
Regulation of nuclear SMAD2/3 signaling
IL3-mediated signaling events
Sumoylation by RanBP2 regulates transcriptional repression
Hedgehog signaling events mediated by Gli proteins
Regulation of Androgen receptor activity
Regulation of Telomerase
Notch signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.88556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004964 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03143 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||