Homo sapiens Gene: RBBP4 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-95780.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RBBP4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | retinoblastoma binding protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | lin-53; NURF55; RBAP48 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000162521 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
retinoblastoma binding protein 4
retinoblastoma binding protein 4
retinoblastoma binding protein 4
retinoblastoma binding protein 4
retinoblastoma binding protein 4
retinoblastoma binding protein 4
retinoblastoma binding protein 4
retinoblastoma binding protein 4
retinoblastoma binding protein 4
retinoblastoma binding protein 4
retinoblastoma binding protein 4
retinoblastoma binding protein 4
retinoblastoma binding protein 4
retinoblastoma binding protein 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a ubiquitously expressed nuclear protein which belongs to a highly conserved subfamily of WD-repeat proteins. It is present in protein complexes involved in histone acetylation and chromatin assembly. It is part of the Mi-2 complex which has been implicated in chromatin remodeling and transcriptional repression associated with histone deacetylation. This encoded protein is also part of co-repressor complexes, which is an integral component of transcriptional silencing. It is found among several cellular proteins that bind directly to retinoblastoma protein to regulate cell proliferation. This protein also seems to be involved in transcriptional repression of E2F-responsive genes. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:32651142-32686211 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p35.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 216 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 18 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Deposition of new CENPA-containing nucleosomes at the centromere pathway
G0 and Early G1 pathway
Polo-like kinase mediated events pathway
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
Cellular responses to stress pathway
PRC2 methylates histones and DNA pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
Mitotic G1-G1/S phases pathway
Chromosome Maintenance pathway
Nucleosome assembly pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
Cell Cycle pathway
HDACs deacetylate histones pathway
Cellular Senescence pathway
Chromatin organization pathway
G2/M Transition pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Mitotic G2-G2/M phases pathway
Oxidative Stress Induced Senescence pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of retinoblastoma protein
Signaling events mediated by HDAC Class I
E2F transcription factor network
Regulation of nuclear SMAD2/3 signaling
Hedgehog signaling events mediated by Gli proteins
Regulation of Telomerase
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.16003 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001135255 NM_001135256 NM_005610 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS366 CCDS44105 CCDS44106 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04232 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||