Homo sapiens Gene: SF3A3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-96552.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SF3A3 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | splicing factor 3a, subunit 3, 60kDa | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | PRP9; PRPF9; SAP61; SF3a60 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000183431 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
splicing factor 3a, subunit 3, 60kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes subunit 3 of the splicing factor 3a protein complex. The splicing factor 3a heterotrimer includes subunits 1, 2 and 3 and is necessary for the in vitro conversion of 15S U2 snRNP into an active 17S particle that performs pre-mRNA splicing. Subunit 3 interacts with subunit 1 through its amino-terminus while the zinc finger domain of subunit 3 plays a role in its binding to the 15S U2 snRNP. This gene has a pseudogene on chromosome 20. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:37956975-37990921 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p34.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 80 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.77897 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_006802 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS428 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 10411 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||