Homo sapiens Gene: TNFAIP3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-97033.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TNFAIP3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | A20; OTUD7C; TNFA1P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000118503 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
TNFAIP3 restricts TLR signals by restricting ubiquitination of TRAF6 and restricts MyD88-independent TLR signals by inhibiting Toll/interleukin 1 receptor domain-containing adaptor inducing interferon (IFN) beta (TICAM1)-dependent nuclear factor kappaB signals but not IFN response factor 3 signalling.
TNFAIP3 restricts NOD2 triggered signals by deubiquitinating RIPK2.
TNFAIP3 negatively regulates the RIG-I antiviral state by blocking IRF- and NF-kappaB-mediated gene expression.
TNFAIP3 negatively regulates BCL10- and CARMA3-mediated activation of NF-kappaB by means of its deubiquitylation activity and preventing assembly of the complex containing CARMA3, BCL10 and IKBKG (NEMO).
TNFAIP3 removes lysine-63 linked ubiquitin chains from RIPK1 and polyubiquitinates RIPK1 with K48-linked ubiquitin chains, targeting it for proteosomal degradation, and hence down-regulating NF-kappaB signalling pathway.
TNFAIP3 is phosphorylated by IKBKB and this increases the ability of TNFAIP3 to inhibit the NF-kappaB signalling pathway.
TNFAIP3 is an early NF-kappaB-responsive gene that encodes a ubiquitin-editing protein that is involved in the negative feedback regulation of NF-kappaB signalling and thus is a central gatekeeper in inflammation and immunity.
TNFAIP3 (A20) and TAX1BP1 inhibit antiviral signaling by targeting TBK1/IKKi kinases and disrupting a TRAF3-TBK1-IKKi signalling complex.
TNFAIP3 and TRAF6 differentially regulate TLR4-induced autophagy during inflammatory responses by modulating K63-linked ubiquitination of BECN1 (Beclin 1).
TNFAIP3 is a deubiquitinase that counteracts E3 ligases and therefore play a prominent role in the down-regulation of NF-κB signalling and homeostasis.
TNFAIP3 expression and TNFAIP3-IRAK1interaction are important for endotoxin tolerance. TNFAIP3 over-expression inhibits LPS-induced activation of NFKB, and is mechanistically linked to endotoxin tolerance through the reprogramming of TLR4 signalling.
TNFAIP3 promotes intestinal epithelial barrier integrity and inhibits LPS-induced loss of the tight junction protein occludin. (Demonstrated in mice)
Haploinsufficiency of A20 (HA20) is caused by high-penetrance loss-of-function germline mutations in TNFAIP3 with increased degradation of NFKBIA, nuclear translocation of RELA, increased expression of NFκB mediated proinflammatory cytokines, and defective deubiquitinating activity.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Tnfaip3 expression and Tnfaip3-Irak1interaction are important for endotoxin tolerance. Tnfaip3 overexpression inhibits LPS-induced activation of NFKB, and is mechanistically linked to endotoxin tolerance through the reprogramming of Tlr4 signaling.
[Mus musculus] Tnfaip3 promotes intestinal epithelial barrier integrity and inhibits LPS-induced loss of the tight junction protein occludin.
[Mus musculus] Tnfaip3 is regulated by both Nf-κB and p38-dependent Cebpb in response to LPS in macrophages.
[Mus musculus] Mirlet7f and its target Tnfaip3 regulate immune responses to Mycobacterium tuberculosis and control bacterial burden by augmenting the production of Tnf and Il1b.
[Mus musculus] Sqstm1 captures Tnfaip3, an NFkB inhibitor, and sequesters it in the autophagosome. This allows macrophages to release chemokines that recruit neutrophils and boost antifungal immunity.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene was identified as a gene whose expression is rapidly induced by the tumor necrosis factor (TNF). The protein encoded by this gene is a zinc finger protein and ubiqitin-editing enzyme, and has been shown to inhibit NF-kappa B activation as well as TNF-mediated apoptosis. The encoded protein, which has both ubiquitin ligase and deubiquitinase activities, is involved in the cytokine-mediated immune and inflammatory responses. Several transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:137867188-137883312 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q23.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 130 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 20 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
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REACTOME |
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
NOD1/2 Signaling Pathway pathway
Innate Immune System pathway
Nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor (NLR) signaling pathways pathway
Immune System pathway
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KEGG |
NOD-like receptor signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
CD40/CD40L signaling
TNF receptor signaling pathway
Canonical NF-kappaB pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.211600 Hs.715063 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001270507 NM_001270508 NM_006290 XM_005267119 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||