Homo sapiens Gene: ARID1B | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-98322.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ARID1B | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | AT rich interactive domain 1B (SWI1-like) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000049618 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
AT rich interactive domain 1B (SWI1-like)
AT rich interactive domain 1B (SWI1-like)
AT rich interactive domain 1B (SWI1-like)
AT rich interactive domain 1B (SWI1-like)
AT rich interactive domain 1B (SWI1-like)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This locus encodes an AT-rich DNA interacting domain-containing protein. The encoded protein is a component of the SWI/SNF chromatin remodeling complex and may play a role in cell-cycle activation. The protein encoded by this locus is similar to AT-rich interactive domain-containing protein 1A. These two proteins function as alternative, mutually exclusive ARID-subunits of the SWI/SNF complex. The associated complexes play opposing roles. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Feb 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:156777929-157210779 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q25.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 39 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Chromatin organization pathway
RMTs methylate histone arginines pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.614401 Hs.743329 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_017519 NM_020732 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5251 CCDS55072 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 10660 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||