Homo sapiens Gene: LRP8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-98740.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LRP8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | APOER2; HSZ75190; LRP-8; MCI1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000157193 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor
low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor
low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor
low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor
low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor
low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor
low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor
low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor
low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor
low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the low density lipoprotein receptor (LDLR) family. Low density lipoprotein receptors are cell surface proteins that play roles in both signal transduction and receptor-mediated endocytosis of specific ligands for lysosomal degradation. The encoded protein plays a critical role in the migration of neurons during development by mediating Reelin signaling, and also functions as a receptor for the cholesterol transport protein apolipoprotein E. Expression of this gene may be a marker for major depressive disorder. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:53245539-53328070 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p32.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 24 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Platelet sensitization by LDL pathway
Platelet homeostasis pathway
Retinoid metabolism and transport pathway
Signal Transduction pathway
Diseases associated with visual transduction pathway
Visual phototransduction pathway
Disease pathway
Hemostasis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Reelin signaling pathway
Lissencephaly gene (LIS1) in neuronal migration and development
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.280387 Hs.576154 Hs.610556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001018054 NM_004631 NM_017522 NM_033300 XM_005271176 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS30720 CCDS578 CCDS579 CCDS580 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||