Homo sapiens Gene: RPE65 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-99605.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RPE65 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | retinal pigment epithelium-specific protein 65kDa | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BCO3; LCA2; mRPE65; rd12; RP20; sRPE65 | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000116745 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
retinal pigment epithelium-specific protein 65kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein which is located in the retinal pigment epithelium and is involved in the production of 11-cis retinal and in visual pigment regeneration. There are two forms of this protein, a soluble form called sRPE65, and a palmitoylated, membrane-bound form known as mRPE65. mRPE65 serves as the palmitoyl donor for lecithin retinol acyl transferase (LRAT), the enzyme that catalyzes the vitamin A to all trans retinol step of the chromophore regeneration process. Both mRPE65 and sRPE65 also serve as regulatory proteins, with the ratio and concentrations of these molecules playing a role in the inhibition of 11-cis retinal synthesis. Mutations in this gene have been associated with Leber congenital amaurosis type 2 (LCA2) and retinitis pigmentosa. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:68428822-68449959 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | p31.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
The canonical retinoid cycle in rods (twilight vision) pathway
Signal Transduction pathway
Diseases associated with visual transduction pathway
Visual phototransduction pathway
Disease pathway
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KEGG |
Retinol metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Visual signal transduction: Cones
Visual signal transduction: Rods
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q16518 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C7FEP0 Q2EKB8 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6121 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.2133 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000329 XM_006710811 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10294 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 180069 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS643 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF039855 AF039856 AF039857 AF039858 AF039859 AF039860 AF039861 AF039862 AF039863 AF039864 AF039865 AF039866 AF039867 AF039868 AK289925 AL139413 BC075035 BC075036 CH471059 DQ374435 GQ352640 U18991 U20476 U20477 U20478 U20479 U20481 U20482 U20484 U20485 U20486 U20510 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA99012 AAC14586 AAC39660 AAH75035 AAH75036 ABD37636 ACT83679 BAF82614 CAI18957 EAX06478 | ||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 6121 | ||||||||||||||||||||||||||