Homo sapiens Protein: T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-98924.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | T, brachyury homolog (mouse) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SAVA; TFT; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000296946 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-98920 (T) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Involved in the transcriptional regulation of genes required for mesoderm formation and differentiation. Binds to a palindromic site (called T site) and activates gene transcription when bound to such a site. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Neural tube defects (NTD) [MIM:182940]: Congenital malformations of the central nervous system and adjacent structures related to defective neural tube closure during the first trimester of pregnancy. Failure of neural tube closure can occur at any level of the embryonic axis. Common NTD forms include anencephaly, myelomeningocele and spina bifida, which result from the failure of fusion in the cranial and spinal region of the neural tube. NTDs have a multifactorial etiology encompassing both genetic and environmental components. {ECO:0000269PubMed:15449172}. Note=Disease susceptibility is associated with variations affecting the gene represented in this entry.Chordoma (CHDM) [MIM:215400]: Rare, clinically malignant tumors derived from notochordal remnants. They occur along the length of the spinal axis, predominantly in the sphenooccipital, vertebral and sacrococcygeal regions. They are characterized by slow growth, local destruction of bone, extension into adjacent soft tissues and rarely, distant metastatic spread. {ECO:0000269PubMed:19801981}. Note=Disease susceptibility is associated with variations affecting the gene represented in this entry. Susceptibility to development of chordomas is due to a T gene duplication. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001699
Transcription factor, T-box IPR002070 Transcription factor, Brachyury IPR008967 p53-like transcription factor, DNA-binding |
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PFAM |
PF00907
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PRINTS |
PR00937
PR00938 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00425
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O15178 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O15178 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H0YM91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6862 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.389457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_003172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11515 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601397 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03236 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ001699 AL627443 BC098425 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH98425 CAA04938 CAI14269 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||