Homo sapiens Gene: VCAM1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-100525.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | VCAM1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | vascular cell adhesion molecule 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD106; INCAM-100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000162692 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
vascular cell adhesion molecule 1
vascular cell adhesion molecule 1
vascular cell adhesion molecule 1
vascular cell adhesion molecule 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the Ig superfamily and encodes a cell surface sialoglycoprotein expressed by cytokine-activated endothelium. This type I membrane protein mediates leukocyte-endothelial cell adhesion and signal transduction, and may play a role in the development of artherosclerosis and rheumatoid arthritis. Three alternatively spliced transcripts encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:100719742-100739045 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p21.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 451 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell pathway
Interferon gamma signaling pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Extracellular matrix organization pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Interferon Signaling pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Malaria pathway
African trypanosomiasis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Thromboxane A2 receptor signaling
Beta1 integrin cell surface interactions
Cellular roles of Anthrax toxin
Beta2 integrin cell surface interactions
Alpha9 beta1 integrin signaling events
Alpha4 beta1 integrin signaling events
a4b7 Integrin signaling
Beta5 beta6 beta7 and beta8 integrin cell surface interactions
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P19320 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F8UU18 F8UV74 G0ZFQ0 G0ZI12 Q68DC4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.109225 Hs.708046 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_080682 NM_001078 NM_001199834 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12663 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 192225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS774 CCDS55617 CCDS773 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC093428 AF536818 AK291732 AK296692 BC017276 BC068490 BC085003 CH471097 CR749464 JF271680 JF280676 JF907575 JF917093 M30257 M60335 M73255 M92431 X53051 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA51917 AAA61269 AAA61270 AAH17276 AAH68490 AAH85003 AAM96190 AEH21939 AEH21940 AEL21381 AEL30503 BAF84421 BAG59286 CAA37218 CAH18296 EAW72950 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 7412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||