Homo sapiens Gene: SCNM1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-102306.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SCNM1 | ||||||||||||||||||
Gene Name | sodium channel modifier 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000163156 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sodium channel modifier 1
sodium channel modifier 1
sodium channel modifier 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring TNFAIP8L2 (tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 2) and SCNM1 (sodium channel modifier 1) genes on chromosome 1. The read-through transcript encodes a protein that shares sequence identity with the downstream gene product but its N-terminal region is shorter due to alternate exon use, compared to the downstream gene. [provided by RefSeq, Mar 2011] SCNM1 is a zinc finger protein and putative splicing factor. In mice, Scnm1 modifies phenotypic expression of Scn8a (MIM 600702) mutations (Buchner et al., 2003 [PubMed 12920299]).[supplied by OMIM, Oct 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:151156664-151170297 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q21.3 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.732060 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001204848 NM_001204856 NM_024041 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS55636 CCDS987 | ||||||||||||||||||
HPRD | 12162 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||