Homo sapiens Gene: COPA | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-104029.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | COPA | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | coatomer protein complex, subunit alpha | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | HEP-COP | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000122218 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
coatomer protein complex, subunit alpha
coatomer protein complex, subunit alpha
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
In eukaryotic cells, protein transport between the endoplasmic reticulum and Golgi compartments is mediated in part by non-clathrin-coated vesicular coat proteins (COPs). Seven coat proteins have been identified, and they represent subunits of a complex known as coatomer. The subunits are designated alpha-COP, beta-COP, beta-prime-COP, gamma-COP, delta-COP, epsilon-COP, and zeta-COP. The alpha-COP, encoded by COPA, shares high sequence similarity with RET1P, the alpha subunit of the coatomer complex in yeast. Also, the N-terminal 25 amino acids of alpha-COP encode the bioactive peptide, xenin, which stimulates exocrine pancreatic secretion and may act as a gastrointestinal hormone. Alternative splicing results in multiple splice forms encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:160289273-160343400 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q23.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 70 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
COPI Mediated Transport pathway
Golgi to ER Retrograde Transport pathway
Membrane Trafficking pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Arf1 pathway
C-MYB transcription factor network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P53621 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1314 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.162121 Hs.656374 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004371 NM_001098398 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2230 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 601924 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1202 CCDS41424 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03564 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AL445230 AL513282 BC038447 CH471121 U24105 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB70879 AAH38447 CAI12454 CAI12455 CAI15004 CAI15005 EAW52723 EAW52725 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 1314 | ||||||||||||||||||||||