Mus musculus Gene: Pnpla6 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-129826.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pnpla6 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | patatin-like phospholipase domain containing 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI661849; MSws; Nte | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000004565 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
patatin-like phospholipase domain containing 6
patatin-like phospholipase domain containing 6
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000032444:
This gene encodes a phospholipase that deacetylates intracellular phosphatidylcholine to produce glycerophosphocholine. It is thought to function in neurite outgrowth and process elongation during neuronal differentiation. The protein is anchored to the cytoplasmic face of the endoplasmic reticulum in both neurons and non-neuronal cells. Mutations in this gene result in autosomal recessive spastic paraplegia, and the protein is the target for neurodegeneration induced by organophosphorus compounds and chemical warfare agents. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2009] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:3515384-3544266 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A1.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Glycerophospholipid metabolism pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Glycerophospholipid metabolism pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.23085 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001122818 NM_015801 XM_006508822 XM_006508823 XM_006508824 XM_006508825 XM_006508826 XM_006508827 XM_006508828 XM_006508829 XM_006508830 XM_006508831 XM_006508832 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40206 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||