Mus musculus Gene: Lyst | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-130720.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Lyst | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | lysosomal trafficking regulator | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | beige; bg; D13Sfk13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000019726 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lysosomal trafficking regulator
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000143669:
This gene is thought to encode a protein that regulates intracellular protein trafficking to and from the lysosome. Mutations in this gene are associated with Chediak-Higashi syndrome, a rare lysosomal storage disorder. Alternatively spliced transcript variants have been described but their full-length nature has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a protein that regulates intracellular protein trafficking in endosomes, and may be involved in pigmentation. Mutations in this gene are associated with Chediak-Higashi syndrome, a lysosomal storage disorder. Alternative splicing results in multiple transcript variants, though the full-length nature of some of these variants has not been determined. [provided by RefSeq, Apr 2013] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:13590409-13777440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 24 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G5E8Q0 Q3U4C2 Q8BN38 Q8BQ04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 17101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.342337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_010748 XM_006516563 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36597 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:107448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Lyst | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC121910 AC171200 AK051786 AK089635 AK154317 CH466561 CT010431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | BAC34768 BAC40935 BAE32510 EDL32764 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 17101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||