Mus musculus Gene: Pacs1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-131026.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pacs1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI325977 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000024855 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
phosphofurin acidic cluster sorting protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000175115:
This gene encodes a protein with a putative role in the localization of trans-Golgi network (TGN) membrane proteins. Mouse and rat homologs have been identified and studies of the homologous rat protein indicate a role in directing TGN localization of furin by binding to the protease's phosphorylated cytosolic domain. In addition, the human protein plays a role in HIV-1 Nef-mediated downregulation of cell surface MHC-I molecules to the TGN, thereby enabling HIV-1 to escape immune surveillance. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:5133688-5273119 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nef mediated downregulation of MHC class I complex cell surface expression pathway
Nef-mediates down modulation of cell surface receptors by recruiting them to clathrin adapters pathway
HIV Infection pathway
The role of Nef in HIV-1 replication and disease pathogenesis pathway
Host Interactions of HIV factors pathway
Disease pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.234923 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_153129 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29453 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||