Mus musculus Gene: Prpf31 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-135774.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Prpf31 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | PRP31 pre-mRNA processing factor 31 homolog (yeast) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1500019O16Rik; 2810404O06Rik; AW554706; PRP31; RP11 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000008373 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PRP31 pre-mRNA processing factor 31 homolog (yeast)
PRP31 pre-mRNA processing factor 31 homolog (yeast)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000105618:
This gene encodes a component of the spliceosome complex and is one of several retinitis pigmentosa-causing genes. When the gene product is added to the spliceosome complex, activation occurs.[provided by RefSeq, Jan 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:3629985-3642486 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 43 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8CCF0 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 68988 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.246863 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_027328 XM_006540346 NM_001159714 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS39729 CCDS51965 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1916238 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Prpf31 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC130680 AK005294 AK033190 AK033283 AK044398 AK044457 AK051260 AY040823 BC018376 BC057877 BC061461 CT010189 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH18376 AAH57877 AAH61461 AAK77987 BAC25109 BAC28192 BAC28220 BAC31903 BAC31931 BAC34578 CAJ18397 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 68988 | ||||||||||||||||||||||