Version 5.4
| Mus musculus Gene: Thsd1 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-140185.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Thsd1 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | thrombospondin, type I, domain 1 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | 4833423O18Rik; Tmtsp | ||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSMUSG00000031480 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
thrombospondin, type I, domain 1
thrombospondin, type I, domain 1
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| Protein Structure | |||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000136114:
The protein encoded by this gene contains a type 1 thrombospondin domain, which is found in a number of proteins involved in the complement pathway, as well as in extracellular matrix proteins. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2009] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 8:22227313-22261334 | ||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
| Band | A2 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
Post-translational protein modification pathway
O-linked glycosylation pathway
Metabolism of proteins pathway
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins pathway
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| KEGG | |||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.32067 Mm.398777 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_001205253 NM_019576 XM_006509173 XM_006509174 XM_006509176 | ||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS22172 | ||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| MGI ID | |||||||||||||||||||
| MGI Symbol | |||||||||||||||||||
| EMBL | |||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||