Mus musculus Gene: Stx5a | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-140633.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Stx5a | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | syntaxin 5A | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 0610031F24Rik; D19Ertd627e; Stx5 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000010110 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
syntaxin 5A
syntaxin 5A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000162236:
This gene encodes a member of the syntaxin or t-SNARE (target-SNAP receptor) family. These proteins are found on cell membranes and serve as the targets for v-SNAREs (vesicle-SNAP receptors), permitting specific synaptic vesicle docking and fusion. The encoded protein regulates endoplasmic reticulum to Golgi transport and plays a critical role in autophagy. Autoantibodies targeting the encoded protein may be a diagnostic marker for endometriosis. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:8741413-8756069 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 28 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
SNARE interactions in vesicular transport pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
SNARE interactions in vesicular transport pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.153061 Mm.454464 Mm.483890 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001167799 NM_019829 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29542 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||