Mus musculus Gene: Carm1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-140748.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Carm1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | coactivator-associated arginine methyltransferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Prmt4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
coactivator-associated arginine methyltransferase 1
coactivator-associated arginine methyltransferase 1
coactivator-associated arginine methyltransferase 1
coactivator-associated arginine methyltransferase 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000142453:
Protein arginine N-methyltransferases, such as CARM1, catalyze the transfer of a methyl group from S-adenosyl-L-methionine to the side chain nitrogens of arginine residues within proteins to form methylated arginine derivatives and S-adenosyl-L-homocysteine. Protein arginine methylation has been implicated in signal transduction, metabolism of nascent pre-RNA, and transcriptional activation (Frankel et al., 2002 [PubMed 11724789]).[supplied by OMIM, Mar 2008] This gene belongs to the protein arginine methyltransferase (PRMT) family. The encoded enzyme catalyzes the methylation of guanidino nitrogens of arginyl residues of proteins. The enzyme acts specifically on histones and other chromatin-associated proteins and is involved in regulation of gene expression. The enzyme may act in association with other proteins or within multi-protein complexes and may play a role in cell type-specific functions and cell lineage specification. A related pseudogene is located on chromosome 9. [provided by RefSeq, Aug 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:21546894-21589487 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 50 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Rora activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation pathway
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Mus musculus biological processes pathway
Chromatin organization pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Circadian Clock pathway
Activation of gene expression by SREBF (SREBP) pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
Orphan transporters pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Gene Expression pathway
PPARA activates gene expression pathway
Developmental Biology pathway
YAP1- and WWTR1 (TAZ)-stimulated gene expression pathway
Generic Transcription Pathway pathway
RMTs methylate histone arginines pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Activation of gene expression by SREBF (SREBP) pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
Circadian Clock pathway
YAP1- and WWTR1 (TAZ)-stimulated gene expression pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Developmental Biology pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
Orphan transporters pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
Chromatin organization pathway
RMTs methylate histone arginines pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Metabolism pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Coregulation of Androgen receptor activity
Direct p53 effectors
Regulation of Androgen receptor activity
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.178115 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_021531 NM_153141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22906 CCDS52736 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||