Mus musculus Gene: Irf4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-141793.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Irf4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | interferon regulatory factor 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI385587; IRF-4; LSIRF; Spip | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000021356 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
interferon regulatory factor 4
interferon regulatory factor 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] IRF4 participates in the regulation of lymphoid cell apoptosis by modulating the efficiency of the Fas-mediated death signal.
[Homo sapiens] IRF4 provides a positive feedback signal for its own gene expression in dendritic cells (DCs) and the expression of IRF4 mRNA, but not of other IRFs, is specifically up-regulated during DC differentiation.
[Homo sapiens] Following NOD2 activation, IRF4 interacts with MYD88, TRAF6, and RIPK2 and downregulates K63-linked polyubiquitinylation of RICK and TRAF6 leading to disruption of NFkB activation pathways.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000137265:
The protein encoded by this gene belongs to the IRF (interferon regulatory factor) family of transcription factors, characterized by an unique tryptophan pentad repeat DNA-binding domain. The IRFs are important in the regulation of interferons in response to infection by virus, and in the regulation of interferon-inducible genes. This family member is lymphocyte specific and negatively regulates Toll-like-receptor (TLR) signaling that is central to the activation of innate and adaptive immune systems. A chromosomal translocation involving this gene and the IgH locus, t(6;14)(p25;q32), may be a cause of multiple myeloma. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:30749226-30766927 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A3.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 69 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 60 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Immune System pathway
Interferon gamma signaling pathway
Interferon Signaling pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interferon alpha/beta signaling pathway
Interferon gamma signaling pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Calcineurin-regulated NFAT-dependent transcription in lymphocytes
IL4-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.4677 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_013674 XM_006516560 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||