Mus musculus Gene: Trim28 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-143983.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trim28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tripartite motif-containing 28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AA408787; KAP-1; KRIP-1; MommeD9; Tif1b; Tif1beta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000005566 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tripartite motif-containing 28
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] TRIM28 interacts with IRF5 and mediates heterochromatinization at M1 macrophage markers (e.g. TNF) to suppress transcription.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000130726:
The protein encoded by this gene mediates transcriptional control by interaction with the Kruppel-associated box repression domain found in many transcription factors. The protein localizes to the nucleus and is thought to associate with specific chromatin regions. The protein is a member of the tripartite motif family. This tripartite motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:13024152-13031035 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 85 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 139 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Gene Expression pathway
Generic Transcription Pathway pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Generic Transcription Pathway pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
p53 pathway
C-MYB transcription factor network
E2F transcription factor network
ATM pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.15701 Mm.489366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20823 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||