Mus musculus Gene: Cldn1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-150373.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cldn1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | claudin 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI596271 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022512 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
claudin 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the claudin family. Claudins are integral membrane proteins and components of tight junction strands. Tight junction strands serve as a physical barrier to prevent solutes and water from passing freely through the paracellular space between epithelial or endothelial cell sheets, and also play critical roles in maintaining cell polarity and signal transductions. The knockout mice lacking this gene die soon after birth as a consequence of dehydration from trandermal water loss, indicating that this gene is indispensable for creating and maintaining the epidermal barrier. The protein encoded by this gene also has gastric tumor suppressive activity, and is a key factor for hepatitis C virus (HCV) entry. [provided by RefSeq, Aug 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:26356642-26371841 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cell-cell junction organization pathway
Cell junction organization pathway
Tight junction interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
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KEGG |
Tight junction pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Tight junction interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
Cell junction organization pathway
Cell-cell junction organization pathway
Cell junction organization pathway
Cell-Cell communication pathway
Cell-cell junction organization pathway
Tight junction interactions pathway
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KEGG |
Pathogenic Escherichia coli infection pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Tight junction pathway
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Nectin adhesion pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.289441 Mm.399637 Mm.406933 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_016674 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28087 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||