Mus musculus Gene: Ppargc1b | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-151805.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ppargc1b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | peroxisome proliferative activated receptor, gamma, coactivator 1 beta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000033871 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
peroxisome proliferative activated receptor, gamma, coactivator 1 beta
peroxisome proliferative activated receptor, gamma, coactivator 1 beta
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Ppargc1b is activated in Staphylococcus aureus-mediated sepsis via the Tlr2-signalling pathway.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] PPARGC1B is activated in Staphylococcus aureus-mediated sepsis via the TLR2-signalling pathway. (Demonstrated in mice)
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000155846:
The protein encoded by this gene stimulates the activity of several transcription factors and nuclear receptors, including estrogen receptor alpha, nuclear respiratory factor 1, and glucocorticoid receptor. The encoded protein may be involved in fat oxidation, non-oxidative glucose metabolism, and the regulation of energy expenditure. This protein is downregulated in prediabetic and type 2 diabetes mellitus patients. Certain allelic variations in this gene increase the risk of the development of obesity. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:61298136-61400431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | E1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 14 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
PPARA activates gene expression pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
Metabolism pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.415302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_133249 XM_006525698 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29284 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||