Mus musculus Gene: Setx | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-153367.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Setx | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | senataxin | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000043535 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
senataxin
senataxin
senataxin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000107290:
This gene encodes a protein named for its homology to the Sen1p protein of fungi which has RNA helicase activity encoded by a domain at the C-terminal end of the protein. The protein encoded by this gene contains a DNA/RNA helicase domain at its C-terminal end which suggests that it may be involved in both DNA and RNA processing. Mutations in this gene have been associated with ataxia-ocular apraxia-2 (AOA2) and an autosomal dominant form of juvenile amyotrophic lateral sclerosis (ALS4). [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:29124181-29182471 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 269254 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.404861 Mm.41867 Mm.472481 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_198033 XM_006498084 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38090 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2443480 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Setx | ||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 269254 | ||||||||||||||||||||||