Mus musculus Gene: Otx2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-155303.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Otx2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | orthodenticle homolog 2 (Drosophila) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | E130306E05Rik | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000021848 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
orthodenticle homolog 2 (Drosophila)
orthodenticle homolog 2 (Drosophila)
orthodenticle homolog 2 (Drosophila)
orthodenticle homolog 2 (Drosophila)
orthodenticle homolog 2 (Drosophila)
orthodenticle homolog 2 (Drosophila)
orthodenticle homolog 2 (Drosophila)
orthodenticle homolog 2 (Drosophila)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein that belongs to the homeobox family of transcription factors. The encoded protein plays a role in the development and patterning of the head. This protein regulates development of the choroid plexuses in the brain affecting composition of cerebrospinal fluid in the developing brain and is thought to function in the development of sense organs in the embryo. In humans, mutations in this gene are associated with pituitary hormone deficiency. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Nov 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:48657679-48667644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | C1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.134516 Mm.405632 Mm.487292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001286481 NM_001286483 NM_144841 XM_006518689 XM_006518690 XM_006518691 XM_006518692 XM_006518694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS49473 CCDS70575 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||