Mus musculus Gene: Ddx6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-157702.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ddx6 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1110001P04Rik; E230023J21Rik; HLR2; mRCK/P54; p54; rck | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032097 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000110367:
This gene encodes a member of the DEAD box protein family. The protein is an RNA helicase found in P-bodies and stress granules, and functions in translation suppression and mRNA degradation. It is required for microRNA-induced gene silencing. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Mar 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:44604892-44640731 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A5.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 30 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA decay by 5' to 3' exoribonuclease pathway
Gene Expression pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME |
mRNA decay by 5' to 3' exoribonuclease pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.267061 Mm.416230 Mm.470466 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001110826 NM_007841 NM_181324 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS23116 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||