Mus musculus Gene: Snrpd3 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-162827.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Snrpd3 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | small nuclear ribonucleoprotein D3 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1700043E15Rik; 2310009E13Rik; AW046420; SMD3 | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020180 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
small nuclear ribonucleoprotein D3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000100028:
The protein encoded by this gene belongs to the small nuclear ribonucleoprotein core protein family. It is required for pre-mRNA splicing and small nuclear ribonucleoprotein biogenesis. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a core component of the spliceosome, which is a nuclear ribonucleoprotein complex that functions in pre-mRNA splicing. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:75517551-75537373 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | C1 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 15 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 66 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing pathway
SLBP independent Processing of Histone Pre-mRNAs pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intronless Pre-mRNA pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
RNA Polymerase II Transcription Termination pathway
Cleavage of Growing Transcript in the Termination Region pathway
snRNP Assembly pathway
Gene Expression pathway
SLBP Dependent Processing of Replication-Dependent Histone Pre-mRNAs pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
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KEGG |
Systemic lupus erythematosus pathway
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
snRNP Assembly pathway
SLBP independent Processing of Histone Pre-mRNAs pathway
SLBP Dependent Processing of Replication-Dependent Histone Pre-mRNAs pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
Cleavage of Growing Transcript in the Termination Region pathway
RNA Polymerase II Transcription Termination pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
Processing of Capped Intronless Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Systemic lupus erythematosus pathway
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_026095 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS23926 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||