Mus musculus Gene: Socs6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-163115.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Socs6 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | suppressor of cytokine signaling 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1500012M23Rik; 5830401B18Rik; AI447482; Cis4; Cish4; HSPC060; SOCS-4; SOCS-6; Socs4; SSI4; STAI4; STATI4 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000056153 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
suppressor of cytokine signaling 6
suppressor of cytokine signaling 6
suppressor of cytokine signaling 6
suppressor of cytokine signaling 6
suppressor of cytokine signaling 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] SOCS6 associates with KIT and regulates KIT receptor signalling and leads to MAPK activation.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000170677:
The protein encoded by this gene contains a SH2 domain and a CIS homolog domain. The protein thus belongs to the cytokine-induced STAT inhibitor (CIS), also known as suppressor of cytokine signaling (SOCS) or STAT-induced STAT inhibitor (SSI), protein family. CIS family members are known to be cytokine-inducible negative regulators of cytokine signaling. The expression of this gene can be induced by GM-CSF and EPO in hematopoietic cells. A high expression level of this gene was found in factor-independent chronic myelogenous leukemia (CML) and erythroleukemia (HEL) cell lines. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:88665224-88927481 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E4 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 23 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 23 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Regulation of KIT signaling pathway
Signaling by SCF-KIT pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH |
JAK STAT pathway and regulation pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
KitReceptor pathway
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REACTOME |
Regulation of KIT signaling pathway
Signaling by SCF-KIT pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH |
JAK STAT pathway and regulation pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9JLY0 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3Z776 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 54607 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.462378 Mm.475026 Mm.484349 Mm.91920 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_018821 XM_006526513 XM_006526514 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29389 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1924885 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Socs6 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC118614 AC122398 AC165161 AF121907 AK019993 AK028665 AK028701 AK031164 AK044946 AK142069 AK156591 BC017597 BC094443 CH466632 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF28872 AAH17597 AAH94443 BAB31956 BAC26055 BAC26074 BAC27287 BAC32154 BAE24930 BAE33770 EDL00645 EDL00646 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 54607 | ||||||||||||||||||||||