Mus musculus Gene: Rpn1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-166698.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rpn1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ribophorin I | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AU018702; D6Wsu137e; Rpn-1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000030062 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ribophorin I
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000163902:
This gene encodes a type I integral membrane protein found only in the rough endoplasmic reticulum. The encoded protein is part of an N-oligosaccharyl transferase complex that links high mannose oligosaccharides to asparagine residues found in the Asn-X-Ser/Thr consensus motif of nascent polypeptide chains. This protein forms part of the regulatory subunit of the 26S proteasome and may mediate binding of ubiquitin-like domains to this proteasome. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:88084473-88105304 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 50 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Translation pathway
Metabolism of proteins pathway
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
N-Glycan biosynthesis pathway
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Asparagine N-linked glycosylation pathway
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane pathway
Post-translational protein modification pathway
Translation pathway
Metabolism of proteins pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
N-Glycan biosynthesis pathway
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q91YQ5 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5RKP4 Q99LY0 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 103963 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.188544 Mm.402349 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_133933 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20332 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:98084 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rpn1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK052130 AK132750 AK151899 AK153867 BC002175 BC016080 BC085483 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH02175 AAH16080 AAH85483 BAC34853 BAE21332 BAE30782 BAE32221 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 103963 | ||||||||||||||||||||||