Mus musculus Gene: Rxrb | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-169595.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rxrb | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | retinoid X receptor beta | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AL023085; H-2RIIBP; Nr2b2; RCoR-1; Rub | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000039656 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
retinoid X receptor beta
retinoid X receptor beta
retinoid X receptor beta
retinoid X receptor beta
retinoid X receptor beta
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000204231:
This gene encodes a member of the retinoid X receptor (RXR) family of nuclear receptors which are involved in mediating the effects of retinoic acid (RA). The encoded protein forms homodimers with the retinoic acid, thyroid hormone, and vitamin D receptors, increasing both DNA binding and transcriptional function on their respective response elements. This gene lies within the major histocompatibility complex (MHC) class II region on chromosome 6. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:34031812-34038393 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | B1 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 47 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Gene Expression pathway
Generic Transcription Pathway pathway
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KEGG |
PPAR signaling pathway pathway
Thyroid cancer pathway
Small cell lung cancer pathway
Adipocytokine signaling pathway pathway
Non-small cell lung cancer pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Non-small cell lung cancer pathway
Thyroid cancer pathway
Small cell lung cancer pathway
PPAR signaling pathway pathway
Adipocytokine signaling pathway pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G3UZ09 Q8VCR0 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20182 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.1243 Mm.411134 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001205215 NM_001205214 NM_001205216 NM_011306 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS57067 CCDS57066 CCDS57068 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:98215 | ||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rxrb | ||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK140371 BC019432 CR974462 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH19432 BAE24359 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20182 | ||||||||||||||||||||||||