Homo sapiens Gene: LGMN | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-17093.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LGMN | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | legumain | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AEP; LGMN1; PRSC1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000100600 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
LGMN is an asparagine endopeptidase that removes the majority of the TLR9 ectodomain, and this catalytic cleavage is required for TLR9 endolysosome signalling in response to DNA. (Demonstrated in murine model)
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Lgmn is an asparagine endopeptidase that removes the majority of the Tlr9 ectodomain, and this catalytic cleavage is required for Tlr9 endolysosome signalling in response to DNA.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a cysteine protease that has a strict specificity for hydrolysis of asparaginyl bonds. This enzyme may be involved in the processing of bacterial peptides and endogenous proteins for MHC class II presentation in the lysosomal/endosomal systems. Enzyme activation is triggered by acidic pH and appears to be autocatalytic. Protein expression occurs after monocytes differentiate into dendritic cells. A fully mature, active enzyme is produced following lipopolysaccharide expression in mature dendritic cells. Overexpression of this gene may be associated with the majority of solid tumor types. This gene has a pseudogene on chromosome 13. Several alternatively spliced transcript variants have been described, but the biological validity of only two has been determined. These two variants encode the same isoform. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:92703807-92748702 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | q32.12 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 15 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Trafficking and processing of endosomal TLR pathway
MHC class II antigen presentation pathway
Vitamin D (calciferol) metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Innate Immune System pathway
Metabolism of steroid hormones and vitamin D pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Antigen processing and presentation pathway
Lysosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.741226 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001008530 NM_005606 XM_005267862 XM_005267863 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9904 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04017 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||