Mus musculus Gene: Scn1b | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-172430.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Scn1b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | sodium channel, voltage-gated, type I, beta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000019194 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sodium channel, voltage-gated, type I, beta
sodium channel, voltage-gated, type I, beta
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000105711:
Voltage-gated sodium channels are heteromeric proteins that function in the generation and propagation of action potentials in muscle and neuronal cells. They are composed of one alpha and two beta subunits, where the alpha subunit provides channel activity and the beta-1 subunit modulates the kinetics of channel inactivation. This gene encodes a sodium channel beta-1 subunit. Mutations in this gene result in generalized epilepsy with febrile seizures plus, Brugada syndrome 5, and defects in cardiac conduction. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Oct 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:31116524-31126945 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interaction between L1 and Ankyrins pathway
Axon guidance pathway
L1CAM interactions pathway
Developmental Biology pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interaction between L1 and Ankyrins pathway
L1CAM interactions pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
L1CAM interactions pathway
Axon guidance pathway
Interaction between L1 and Ankyrins pathway
Developmental Biology pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P97952 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20266 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.1418 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011322 XM_006539693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS21126 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:98247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Scn1b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC009652 BC039140 U46681 U85786 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB49368 AAC53006 AAH09652 AAH39140 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20266 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||