Mus musculus Gene: Gabpa | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-172825.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gabpa | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | GA repeat binding protein, alpha | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | GABPalpha | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000008976 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
GA repeat binding protein, alpha
GA repeat binding protein, alpha
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000154727:
This gene encodes one of three GA-binding protein transcription factor subunits which functions as a DNA-binding subunit. Since this subunit shares identity with a subunit encoding the nuclear respiratory factor 2 gene, it is likely involved in activation of cytochrome oxidase expression and nuclear control of mitochondrial function. This subunit also shares identity with a subunit constituting the transcription factor E4TF1, responsible for expression of the adenovirus E4 gene. Because of its chromosomal localization and ability to form heterodimers with other polypeptides, this gene may play a role in the Down Syndrome phenotype. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:84834925-84863779 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | C3.3 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 24 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.18974 Mm.409966 Mm.449784 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008065 XM_006522905 XM_006522906 XM_006522907 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28284 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||