Homo sapiens Gene: SMG1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-17338.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SMG1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | smg-1 homolog, phosphatidylinositol 3-kinase-related kinase (C. elegans) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 61E3.4; ATX; LIP | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000157106 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
smg-1 homolog, phosphatidylinositol 3-kinase-related kinase (C. elegans)
smg-1 homolog, phosphatidylinositol 3-kinase-related kinase (C. elegans)
SMG1 phosphatidylinositol 3-kinase-related kinase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein involved in nonsense-mediated mRNA decay (NMD) as part of the mRNA surveillance complex. The protein has kinase activity and is thought to function in NMD by phosphorylating the regulator of nonsense transcripts 1 protein. Alternative spliced transcript variants have been described, but their full-length natures have not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a protein involved in nonsense-mediated mRNA decay (NMD) as part of the mRNA surveillance complex. The protein has kinase activity and is thought to function in NMD by phosphorylating the regulator of nonsense transcripts 1 protein. Alternatively spliced transcript variants have been described, but their full-length nature has yet to be determined. [provided by RefSeq, Mar 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:18804853-18926454 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p12.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 43 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.460179 Hs.602626 Hs.622357 Hs.636317 Hs.654650 Hs.733481 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_015092 XM_005255185 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS45430 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 06123 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||