Mus musculus Gene: Tcf3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-174161.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tcf3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | transcription factor 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | A1; AA408400; ALF2; AW209082; bHLHb21; E12; E12/E47; E2A; E47; ME2; Pan1; Pan2; TCF-3; Tcfe2a; VDIR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020167 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transcription factor 3
transcription factor 3
transcription factor 3
transcription factor 3
transcription factor 3
transcription factor 3
transcription factor 3
transcription factor 3
transcription factor 3
transcription factor 3
transcription factor 3
transcription factor 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000071564:
This gene encodes a member of the E protein (class I) family of helix-loop-helix transcription factors. E proteins activate transcription by binding to regulatory E-box sequences on target genes as heterodimers or homodimers, and are inhibited by heterodimerization with inhibitor of DNA-binding (class IV) helix-loop-helix proteins. E proteins play a critical role in lymphopoiesis, and the encoded protein is required for B and T lymphocyte development. Deletion of this gene or diminished activity of the encoded protein may play a role in lymphoid malignancies. This gene is also involved in several chromosomal translocations that are associated with lymphoid malignancies including pre-B-cell acute lymphoblastic leukemia (t(1;19), with PBX1), childhood leukemia (t(19;19), with TFPT) and acute leukemia (t(12;19), with ZNF384). Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene, and a pseudogene of this gene is located on the short arm of chromosome 9. [provided by RefSeq, Sep 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:80409514-80433647 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | C1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 128 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 129 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Myogenesis pathway
CDO in myogenesis pathway
Developmental Biology pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Notch pathway
ID pathway
Wnt pathway
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REACTOME |
CDO in myogenesis pathway
Developmental Biology pathway
Myogenesis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Notch-mediated HES/HEY network
Regulation of nuclear SMAD2/3 signaling
p38 signaling mediated by MAPKAP kinases
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.3406 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001164147 NM_001164148 NM_001164149 NM_001164150 NM_001164151 NM_001164152 NM_001164153 NM_011548 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24022 CCDS48630 CCDS48631 CCDS48632 CCDS48633 CCDS48634 CCDS48635 CCDS48636 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||