Mus musculus Gene: Ocln | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-178074.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ocln | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | occludin | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI503564; Ocl | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000021638 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
occludin
occludin
occludin
occludin
occludin
|
||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000197822:
This gene encodes an integral membrane protein that is required for cytokine-induced regulation of the tight junction paracellular permeability barrier. Mutations in this gene are thought to be a cause of band-like calcification with simplified gyration and polymicrogyria (BLC-PMG), an autosomal recessive neurologic disorder that is also known as pseudo-TORCH syndrome. Alternative splicing results in multiple transcript variants. A related pseudogene is present 1.5 Mb downstream on the q arm of chromosome 5. [provided by RefSeq, Apr 2011] |
||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:100496507-100552718 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | D1 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Tight junction pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Hepatitis C pathway
|
||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Apoptotic cleavage of cell adhesion proteins pathway
Apoptotic cleavage of cellular proteins pathway
Apoptotic execution phase pathway
Apoptosis pathway
|
||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Pathogenic Escherichia coli infection pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Tight junction pathway
Hepatitis C pathway
|
||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
TGF-beta receptor signaling
|
||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E0CZ91 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18260 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.4807 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008756 XM_006517563 XM_006517564 XM_006517565 XM_006517566 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26731 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:106183 | ||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ocln | ||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC158536 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 18260 | ||||||||||||||||||||||||