Mus musculus Gene: Pcdh9 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-183563.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pcdh9 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | protocadherin 9 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000055421 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
protocadherin 9
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the protocadherin family, and cadherin superfamily, of transmembrane proteins containing cadherin domains. These proteins mediate cell adhesion in neural tissues in the presence of calcium. The encoded protein may be involved in signaling at neuronal synaptic junctions. Sharing a characteristic with other protocadherin genes, this gene has a notably large exon that encodes multiple cadherin domains and a transmembrane region. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:93015512-93888732 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E2.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F8VPK8 Q8C421 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 211712 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001081377 XM_006518774 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36992 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1306801 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Pcdh9 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC122355 AC123061 AC123919 AC124454 AC125095 AC132470 AC151831 AK083224 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | BAC38815 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 211712 | ||||||||||||||||||||||