Homo sapiens Gene: CXCL16 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-19403.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | CXCL16 | ||||||||||||||||||
Gene Name | chemokine (C-X-C motif) ligand 16 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000161921 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chemokine (C-X-C motif) ligand 16
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Cxcl16 is a chemoattractant in cerebrospinal fluid in early pneumococcal meningitis where Cxcl16 was found to be upregulated in RAW264.7 macrophages (but not in neutrophils and endothelial cells) upon pneumococcal stimulation. Cxcl16 upregulation in vivo was dependent on Toll-like receptor (TLR) 2/TLR4 and MyD88 signaling.
[Mus musculus] Cxcl16-Cxcr6 crosstalk coordinates the intestinal topography of Il22 secretion required for mucosal defence against Citrobacter rodentium infection.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary | Currently no Entrez Summary Available. You might want to check the Summary Sections of the Orthologs. | ||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:4733526-4739922 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | p13.2 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
G alpha (i) signalling events pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Signaling by GPCR pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
GPCR ligand binding pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Chemokine signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | I3L333 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 58191 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.513885 Hs.737318 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001100812 NM_022059 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:16642 | ||||||||||||||||||
OMIM | 605398 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11052 | ||||||||||||||||||
HPRD | 16103 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC091153 | ||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 58191 | ||||||||||||||||||