Mus musculus Gene: Stat6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-195602.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Stat6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | signal transducer and activator of transcription 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000002147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
signal transducer and activator of transcription 6
signal transducer and activator of transcription 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Stat6 is phosphorylated upon viral infection and translocates to the nucleus to induce genes responsible for immune cell homing.
Stat6 signalling negatively regulates γδ17 T cells, which plays a front-line role in mucosal immunity.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] Signal transducer and activator of transcription 6 (STAT6) is a transcription factor that mediates IL-13 cytokine signaling.
[Homo sapiens] STAT6 plays a role in the interleukin-4 (IL-4)-mediated modulation of TLR4 expression and the responsiveness of cells to lipopolysaccharide (LPS).
[Homo sapiens] STAT6 is phosphorylated upon viral infection and translocates to the nucleus to induce genes responsible for immune cell homing. (Demonstrated in mice)
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000166888:
The protein encoded by this gene is a member of the STAT family of transcription factors. In response to cytokines and growth factors, STAT family members are phosphorylated by the receptor associated kinases, and then form homo- or heterodimers that translocate to the cell nucleus where they act as transcription activators. This protein plays a central role in exerting IL4 mediated biological responses. It is found to induce the expression of BCL2L1/BCL-X(L), which is responsible for the anti-apoptotic activity of IL4. Knockout studies in mice suggested the roles of this gene in differentiation of T helper 2 (Th2) cells, expression of cell surface markers, and class switch of immunoglobulins. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, May 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:127642986-127660957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | D3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 34 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 71 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Innate Immune System pathway
STAT6-mediated induction of chemokines pathway
Immune System pathway
Downstream signal transduction pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
STING mediated induction of host immune responses pathway
Signaling by PDGF pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG |
Jak-STAT signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
IL4 pathway
IL9 pathway
TSLP pathway
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REACTOME |
STING mediated induction of host immune responses pathway
Downstream signal transduction pathway
Signaling by PDGF pathway
Innate Immune System pathway
Signal Transduction pathway
Immune System pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
STAT6-mediated induction of chemokines pathway
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KEGG |
Jak-STAT signaling pathway pathway
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INOH |
IL-4 signaling pathway
JAK STAT pathway and regulation pathway
IL-13 signaling pathway
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PID NCI |
IL12-mediated signaling events
Signaling events mediated by TCPTP
IL4-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P52633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3YU28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.121721 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009284 XM_006513437 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36082 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:103034 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Stat6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC160970 AF481809 AK163053 BC127054 CH466578 L47650 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA79006 AAI27055 AAL82638 BAE37172 EDL24514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||