Mus musculus Gene: Gnat1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-198118.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gnat1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | guanine nucleotide binding protein, alpha transducing 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Gnat-1; Ird1; Ird2; irdc; irdr; Tralpha; transducin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000034837 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
guanine nucleotide binding protein, alpha transducing 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000114349:
Transducin is a 3-subunit guanine nucleotide-binding protein (G protein) which stimulates the coupling of rhodopsin and cGMP-phoshodiesterase during visual impulses. The transducin alpha subunits in rods and cones are encoded by separate genes. This gene encodes the alpha subunit in rods. This gene is also expressed in other cells, and has been implicated in bitter taste transduction in rat taste cells. Mutations in this gene result in autosomal dominant congenital stationary night blindness. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Feb 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:107674477-107679592 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
GPCR downstream signaling pathway
Disease pathway
Signaling by GPCR pathway
G-protein activation pathway
G alpha (i) signalling events pathway
Visual phototransduction pathway
Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade pathway
The phototransduction cascade pathway
Opioid Signalling pathway
Signal Transduction pathway
Diseases associated with visual transduction pathway
Activation of the phototransduction cascade pathway
PLC beta mediated events pathway
G-protein mediated events pathway
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KEGG |
Phototransduction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
G alpha (i) signalling events pathway
PLC beta mediated events pathway
G-protein activation pathway
Opioid Signalling pathway
Activation of the phototransduction cascade pathway
Signaling by GPCR pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
G-protein mediated events pathway
Diseases associated with visual transduction pathway
Visual phototransduction pathway
The phototransduction cascade pathway
Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade pathway
Disease pathway
G-protein activation pathway
Signaling by GPCR pathway
The phototransduction cascade pathway
Visual phototransduction pathway
G alpha (i) signalling events pathway
Activation of the phototransduction cascade pathway
Signal Transduction pathway
Diseases associated with visual transduction pathway
G-protein mediated events pathway
GPCR downstream signaling pathway
PLC beta mediated events pathway
Opioid Signalling pathway
Disease pathway
Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade pathway
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KEGG |
Phototransduction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Visual signal transduction: Rods
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008140 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS23504 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||