Mus musculus Gene: Dag1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-199494.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Dag1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | dystroglycan 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | D9Wsu13e; DG; Dp427; Dp71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000039952 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
dystroglycan 1
dystroglycan 1
dystroglycan 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000173402:
Dystroglycan is a laminin binding component of the dystrophin-glycoprotein complex which provides a linkage between the subsarcolemmal cytoskeleton and the extracellular matrix. Dystroglycan 1 is a candidate gene for the site of the mutation in autosomal recessive muscular dystrophies. The dramatic reduction of dystroglycan 1 in Duchenne muscular dystrophy leads to a loss of linkage between the sarcolemma and extracellular matrix, rendering muscle fibers more susceptible to necrosis. Dystroglycan also functions as dual receptor for agrin and laminin-2 in the Schwann cell membrane. The muscle and nonmuscle isoforms of dystroglycan differ by carbohydrate moieties but not protein sequence. Alternative splicing results in multiple transcript variants all encoding the same protein.[provided by RefSeq, Apr 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:108205955-108263924 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 19 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 34 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Extracellular matrix organization pathway
Integrin cell surface interactions pathway
ECM proteoglycans pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
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KEGG |
ECM-receptor interaction pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Viral myocarditis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Integrin cell surface interactions pathway
Extracellular matrix organization pathway
ECM proteoglycans pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
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KEGG |
ECM-receptor interaction pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Viral myocarditis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.473255 Mm.7524 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001276481 NM_001276482 NM_001276485 NM_001276486 NM_001276492 NM_001276493 NM_001276494 NM_010017 XM_006511636 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS23518 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||